Video âm nhạc của "Signal" được đạo diễn bởi Naive Creative Production, một nhóm sản xuất các video âm nhạc trước đó của Twice. MV vượt qua 100 triệu lượt xem trên YouTube vào ngày 30 tháng 8 năm 2017, sau ba tháng phát hành.[9][10] Ngày 7 tháng 12, có thông báo rằng video âm nhạc đứng vị trí thứ hai trong các video âm nhạc phổ biến nhất tại Hàn Quốc năm đó, chỉ sau vị trí dẫn đầu của "Knock Knock".[11][12] Nó cũng đứng ở vị trí thứ 9 trong các Video âm nhạc hàng đầu trên YouTube Nhật Bản năm 2017.[13]

MV có chủ đề viễn tưởng miêu tả một người ngoài hành tinh và chín thành viên của Twice với các siêu năng lực của chính họ, từ siêu tốc độ, siêu thể lực, khả năng tàng hình, siêu năng ngoại cảm đến que xóa trí nhớ trong "Đặc vụ áo đen" và nhiều hơn nữa. Người quay phim xuất hiện trong video âm nhạc "Cheer Up" cũng được xuất hiện. Cuối MV, các thành viên biến thành người ngoài hành tinh.[14][15][16]